Fondée en 2004, Cartier Énergie Éolienne est un partenariat entre deux entreprises actives dans le domaine de l’énergie : TransCanada et Innergex Énergie Renouvelable.
 
Le développement des projets éoliens de Cartier Énergie Éolienne a débuté avec les premières mesures de vent en Gaspésie dès le début des années 2000. Ainsi, ce sont des projets longuement étudiés et basés sur des données fiables qui ont été présentés lors de l’appel d’offres d’Hydro-Québec Distribution pour la production de 1000 MW d'énergie éolienne en juin 2004.
 
En octobre 2004, Cartier Énergie Éolienne a remporté les six projets soumis lors de l’appel d’offres, représentant ainsi près des trois quarts de la puissance éolienne à installer au Québec.
 
Le 25 février 2005, les contrats d’achat d’électricité à long terme avec Hydro-Québec Distribution ont été signés par Cartier Énergie Éolienne, et ce, pour 739,5 mégawatts (MW) de projets éoliens situés dans la région de Gaspésie-Îles-de-la-Madeleine et de la MRC de Matane. Grâce à ses six contrats, Cartier Énergie Éolienne deviendra un des plus grands producteurs d’énergie éolienne au Québec.  

Trois des six parcs éoliens de Cartier Énergie Éolienne sont présentement en opération, soit ceux de Baie-des-Sables, L’Anse-à-Valleau et Carleton, pour un total de 319,5 MW d’énergie éolienne. La construction des prochains parcs éoliens, soit ceux de Gros-Morne (211,5 MW) et de Montagne Sèche (58,5 MW), débutera au printemps 2010.